CREAN MÉTODO PARA FIJAR LA FUNCIÓN DE LAS PROTEÍNAS

Resumen

GABRIEL DEL RÍO, DEL INSTITUTO DE FISIOLOGÍA CELULAR, DESARROLLÓ UN NOVEDOSO MÉTODO BIOINFORM TICO QUE SIRVE PARA ESTABLECER LA RELACIÓN ESTRUCTURA-FUNCIÓN DE LAS PROTEÍNAS A PARTIR DE PRINCIPIOS B SICOS. UNO DE SUS USOS SER  EN EL DISEÑO DE F RMACOS ASISTIDOS POR COMPUTADORA, CON LA EXPECTATIVA DE MEJORAR LA EFICIENCIA DE LOS MÉTODOS ACTUALES DE DISEÑO. CON ESTE PROCEDIMIENTO -MEDIANTE EL CUAL PODR N INTERACTUAR INVESTIGADORES DE TODO EL MUNDO- SE DETERMINA LA FUNCIÓN DE MOLÉCULAS, EN ESPECIAL DE LAS PROTEÍNAS, BAS NDOSE ÚNICAMENTE EN SU FORMA, DETALLÓ EL CIENTÍFICO UNIVERSITARIO. "SI SE CONOCE LA ESTRUCTURA DE UNA PROTEÍNA ES POSIBLE DISEÑAR UN F RMACO QUE CONTROLE SU FUNCIÓN", AFIRMÓ EL EXPERTO, QUIEN CONTÓ CON LA COLABORACIÓN DE UN MÉDICO ESTADUNIDENSE, UN MATEM TICO FRANCÉS Y UN PROGRAMADOR ESTADUNIDENSE DE 15 AÑOS, HOY ALUMNO DE BIOINFORM TICA. EL PROGRAMA DE CÓMPUTO JAMMING, SIGLAS EN INGLÉS DE JAVA-BASED MULTITHREADED MINIMUM INTERACTIVE NETWORKS GUI-GRAPHICAL USER INTERFACE-, ES LIBRE Y PUEDE SER CONSULTADO EN INTERNET DESDE CUALQUIER PARTE DEL PLANETA (HTTP://BIS.IFC.UNAM.MX/JAMMING/) POR ESPECIALISTAS DE BIOLOGÍA Y BIOINFORM TICA, ASÍ COMO BAJARLO EN UNA M QUINA O CONJUNTO DE ELLAS (CLUSTERS) CUANDO SE DESEE HACER AN LISIS MÚLTIPLES DE PROTEÍNAS. EL ESPECIALISTA EXPLICÓ QUE ES IMPORTANTE INFERIR LA FUNCIÓN DE LAS MOLÉCULAS CONOCIENDO SÓLO SU FORMA. ES COMO SABER A QUÉ SE DEDICA UNA PERSONA CON EL SÓLO HECHO DE VERLA. HOY SE TIENE ACCESO A LA LISTA DE COMPONENTES GENÉTICOS DE UN SER VIVO. ESO SERÍA EQUIVALENTE A TENER UN DIRECTORIO CON LOS NOMBRES DE TODOS LOS HABITANTES DE UNA CIUDAD; NO OBSTANTE, ESO NO INCLUYE LA ACTIVIDAD DE CADA UNO. "SI CONOCIÉRAMOS LAS FUNCIONES DE CADA QUIEN, SE ENTENDERÍA MEJOR EL CONJUNTO Y SUS CAPACIDADES". DEL RÍO RECORDÓ QUE, HASTA AHORA, LA MEJOR APROXIMACIÓN A LA PREDICCIÓN DE LA FUNCIÓN DE UNA PROTEÍNA SE DABA MEDIANTE COMPARACIONES. POR EJEMPLO, SI ALGÚN GRUPO DE INVESTIGACIÓN CARACTERIZABA LA ACCIÓN DE CIERTO GENE EN UNA MOSCA, Y ÉSTE SE PARECÍA A OTRO, EN HUMANO, SE ASUMÍA QUE TENÍAN LA MISMA TAREA. NO OBSTANTE, POR ESTE MÉTODO SÓLO SE HA PODIDO DETERMINAR LA FUNCIÓN DE 50 POR CIENTO DE GENES. EL CIENTÍFICO REFIRIÓ QUE LAS FORMAS DE LAS MOLÉCULAS SON VARIABLES. DE LA MISMA MANERA, LOS SERES HUMANOS SE PARECEN, TIENEN IGUAL ESTRUCTURA: CABEZA, BRAZOS, PIERNAS, PERO NO SON IDÉNTICOS; HAY TANTOS TIPOS COMO INDIVIDUOS. LO MISMO OCURRE CON LAS PROTEÍNAS. CLASIFICARLAS DE ACUERDO CON SU FUNCIÓN IMPLICA RECONOCER LAS HABILIDADES SURGIDAS A PARTIR DE ESTAS DIFERENCIAS, Y QUE NO SON EXPLICADAS POR LOS ELEMENTOS COMUNES ENTRE ÉSTAS. DIJO QUE JAMMING ES SÓLO EL PRIMER PASO PARA IDENTIFICAR LO FUNCIONALMENTE IMPORTANTE. LO QUE SIGUE ES LA APLICACIÓN DE ESTA METODOLOGÍA, POR EJEMPLO, EN EL DISEÑO DE F RMACOS POR COMPUTADORA; EL DISEÑO DE F RMACOS HA SIDO EMPLEADO ANTES PARA BLOQUEAR A LA PROTEASA DEL VIRUS DEL VIH, SU MOLÉCULA ESENCIAL, Y ÚTIL EN EL TRATAMIENTO CONTRA EL SIDA. LA META, DIJO, ES AUMENTAR LA EFECTIVIDAD DEL DISEÑO DE F RMACOS, QUE AÚN ES BAJA. LA INVESTIGACIÓN FUE DADA A CONOCER EN LA PRESTIGIADA REVISTA CIENTÍFICA "PLOS ONE"; FUE FINANCIADA POR LA DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO, EL CONACYT Y POR EL MACROPROYECTO DE LA UNAM TECNOLOGÍAS PARA LA UNIVERSIDAD DE LA INFORMACIÓN Y DE LA COMPUTACIÓN.