INVESTIGAN EN GENÓMICAS LA DIVERSIDAD BACTERIANA

Resumen

LA DIVERSIDAD DE BACTERIAS ES UN UNIVERSO AÚN POR DESCUBRIR, PUES SE IGNORAN CASI TODAS LAS CARACTERÍSTICAS DE SU ENTORNO ECOLÓGICO Y SUS RELACIONES EVOLUTIVAS, AFIRMÓ PABLO VINUESA, INVESTIGADOR DEL CENTRO DE CIENCIAS GENÓMICAS. "LAS BACTERIAS QUE TRADICIONALMENTE HAN INTERESADO A LA CIENCIA SON POCAS EN RELACIÓN CON SU GRAN VARIEDAD, SE RELACIONAN CON ENFERMEDADES Y TIENEN UNA GRAN IMPORTANCIA CLÍNICA, SIN EMBARGO SE HAN ESTUDIADO AISLADAS, DE FORMA SESGADA, CON DESCONOCIMIENTO DEL ASPECTO ECOLÓGICO", SEÑALÓ. PARA ESCUDRIÑAR EL AMBIENTE NATURAL DE LAS BACTERIAS EN ECOSISTEMAS CONSERVADOS Y CONTAMINADOS CERCANOS A CUERNAVACA, VINUESA DESARROLLA UN PROYECTO DE INVESTIGACIÓN PARA ESTUDIAR DOS GRUPOS DE BACTERIAS -RIZOBIOS Y MICOBACTERIAS- EN ECOSISTEMAS NATURALES EN BUEN ESTADO DE CONSERVACIÓN, ASÍ COMO EN HÁBITAT CONTAMINADOS POR EL SER HUMANO QUE MODIFICAN SUS POBLACIONES ASOCIADAS CON AGUAS NEGRAS Y SUELOS DAÑADOS. "LA PRESENCIA DE LOS SERES HUMANOS NO SOLAMENTE HA AFECTADO A OTROS ANIMALES Y A LAS PLANTAS, SINO TAMBIÉN A MICROORGANISMOS ESENCIALES COMO LAS BACTERIAS, DE LAS QUE SABEMOS MUY POCO PERO FUNDAMENTALES PARA LA VIDA EN EL PLANETA", COMENTÓ EL ESPECIALISTA. AÑADIÓ QUE PLANTAS Y ANIMALES SON UNA PARTE ÍNFIMA DE LA DIVERSIDAD, Y SON LOS MICROBIOS LA BASE DEL FUNCIONAMIENTO DEL PLANETA. "SON LOS QUE INVENTARON LA FIJACIÓN DEL NITRÓGENO, LA FOTOSÍNTESIS Y EL SISTEMA DE TRANSFORMACIÓN DE LA ENERGÍA DEL SOL PARA APROVECHAR EL AGUA Y, A PARTIR DE AHÍ, SINTETIZAR AZÚCARES", ASEGURÓ. "NOSOTROS, POR SER ORGANISMOS MACROSCÓPICOS TENEMOS UN CIERTO RASGO DE ARROGANCIA, AUNQUE EXPLORANDO EL UNIVERSO DE LAS BACTERIAS PODEMOS RESPONDER A PREGUNTAS COMO POR QUÉ HAY TANTAS ENFERMEDADES O POR QUÉ UN SUELO DE CULTIVO HA DEJADO DE SER FÉRTIL", INDICÓ. PARA SU ESTUDIO, VINUESA Y SUS COLABORADORES MUESTREAN BACTERIAS Y LAS LLEVAN AL LABORATORIO PARA ANALIZARLAS MOLECULAR Y GENÓMICAMENTE. "DESARROLLAMOS UNA APROXIMACIÓN A ESCALA GENÓMICA PARA TRATAR DE IDENTIFICAR MARCADORES MOLECULARES, FRAGMENTOS DE GENES QUE CONTIENEN INFORMACIÓN MUY VALIOSA PARA ESTE TIPO DE ESTUDIOS DE DIVERSIDAD, TANTO A NIVEL DE GENÉTICA DE POBLACIONES COMO DE FILOGENIAS, PARA CONOCER NUEVOS LINAJES DE BACTERIAS QUE VA RECUPERANDO EL AMBIENTE, PUES QUEREMOS SABER DE QUÉ MICROORGANISMOS SE TRATA", SEÑALÓ EL ACADÉMICO. LA FORMA MÁS EFICIENTE PARA REALIZAR ESA INVESTIGACIÓN IMPLICA UN ANÁLISIS COMPARATIVO DE SECUENCIAS DE DISTINTOS GENES. "TRADICIONALMENTE, SE HA SELECCIONADO UN SOLO GENE, EL 16 RIBOSOMAL, PORQUE LO TENEMOS TODOS LOS ORGANISMOS CONOCIDOS Y ES FUNDAMENTAL PARA LOS RIBOSOMAS, QUE SON LAS MÁQUINAS QUE HACEN LA SÍNTESIS DE PROTEÍNAS. PERO ES MUCHO MÁS PODEROSA LA OPCIÓN DE USAR MÚLTIPLES GENES, SOBRE TODO SI CODIFICAN PARA PROTEÍNAS, Y UTILIZARLOS CON MÉTODOS ANALÍTICOS AVANZADOS", CONSIDERÓ. PARA PROGRESAR EN LA CARACTERIZACIÓN DE BACTERIAS EN ECOSISTEMAS TANTO CONSERVADOS COMO CONTAMINADOS, VINUESA DESARROLLÓ UN MARCO CONCEPTUAL Y COMPUTACIONAL. "SE TRATA DE UNA TUBERÍA DE ANÁLISIS QUE UTILIZA LA INFORMACIÓN DE LOS GENOMAS PARA IDENTIFICAR SEGMENTOS DE GENES QUE SEAN PARTICULARMENTE INFORMATIVOS PARA DEVELAR LAS RELACIONES EVOLUTIVAS ENTRE ESE GRUPO DE ORGANISMOS QUE QUEREMOS INVESTIGAR", ACLARÓ. ESOS ESTUDIOS, QUE REQUIEREN DE BIOINFORMÁTICA PARA ALMACENAR Y EXAMINAR GRAN CANTIDAD DE DATOS, IMPLICAN TOMAR MUESTRAS, EXAMINAR SU ADN Y ELEGIR MARCADORES MOLECULARES QUE REVELEN CARACTERÍSTICAS DE LAS BACTERIAS EN CONSIDERACIÓN DE SU ENTORNO. "HAY UN PROCESO DE OBTENCIÓN DE MATERIALES REPRESENTATIVOS CON UNA APROXIMACIÓN COMPUTACIONAL", INFORMÓ. LAS BACTERIAS RIZOBIOS ESTÁN ASOCIADAS SIMBIÓTICAMENTE CON LEGUMINOSAS, Y NO DEPENDEN DE ESAS PLANTAS PARA SU SOBREVIVENCIA. EN TANTO, LAS MICOBACTERIAS SE RELACIONAN CON ENFERMEDADES COMO LA TUBERCULOSIS Y LA LEPRA, AUNQUE LAS CAUSANTES DE ESTOS MALES SON SÓLO DOS VARIANTES DE UNA GRAN DIVERSIDAD DE MICROORGANISMOS, AGREGÓ EL INVESTIGADOR. "LAS RIZOBIOS SE HAN ESTUDIADO BÁSICAMENTE POR SU ASOCIACIÓN CON LEGUMINOSAS COMO EL FRIJOL, SOYA, ALFALFA Y GARBANZO, PERO SON SIMBIONTES OBLIGADOS, PUEDEN VIVIR EN EL SUELO, EN UN PLÁSMIDO (QUE ES UN ANILLO DE ADN) O DESARROLLAR UNA TRANSFERENCIA GENÉTICA HORIZONTAL", DIJO VINUESA. "LA VARIEDAD BACTERIANA ES INMENSA, Y CON ESTA INVESTIGACIÓN PODEMOS ADENTRARNOS TAMBIÉN EN LA ECOLOGÍA DE BACTERIAS EN EL SUELO", ACLARÓ.TRAS EXTRAER EL ADN DE BACTERIAS, VINUESA Y SU EQUIPO GENERAN LIBRERÍAS DE FRAGMENTOS DE LAS BACTERIAS, ÚTILES PARA CONOCER LA DIVERSIDAD MEDIANTE ESTUDIOS ANALÍTICOS Y COMPARATIVOS, NECESARIOS PARA RECREAR EL CONTEXTO ECOLÓGICO DE LAS BACTERIAS.